అనేక ప్రోటీన్-ప్రోటీన్ పరస్పర చర్యలు పెప్టైడ్ రికగ్నిషన్ మాడ్యూల్స్, చిన్న పెప్టైడ్‌లతో బంధించే కాంపాక్ట్ డొమైన్‌ల ద్వారా మధ్యవర్తిత్వం వహించబడతాయి మరియు విస్తృతమైన జీవ ప్రక్రియలలో కీలక పాత్ర పోషిస్తాయి. ఇటీవలి ప్రయోగాత్మక ప్రోటీన్ ఇంటరాక్షన్ డేటా మేము గణన క్రమ విశ్లేషణ ద్వారా వాటి పరస్పర చర్యలను వివరించగలమో లేదా అంచనా వేయగలమో పరిశీలించడానికి మాకు అవకాశాన్ని అందిస్తుంది.
ప్రోటీన్-పెప్టైడ్ పరస్పర చర్యల రూపకల్పన విస్తృతమైన ఆచరణాత్మక అనువర్తనాలను కలిగి ఉంది మరియు పరమాణు గుర్తింపు కోసం ఆధారంపై అంతర్దృష్టిని కూడా వెల్లడిస్తుంది.
పెప్టైడ్ యొక్క బైండింగ్ భాగస్వాములను గుర్తించడానికి సులభమైన పద్ధతి ఏమిటంటే, దానిని అనుబంధ పుల్-డౌన్ ప్రయోగంలో ఎరగా ఉపయోగించడం, ఆపై దాని బైండింగ్ ప్రోటీన్‌లను నేరుగా గుర్తించడం. ఇతర సాంకేతికతలను (ఉదా, కో-ఇమ్యునోప్రెసిపిటేషన్) ఉపయోగించి అంచనా వేయబడిన ప్రోటీన్-ప్రోటీన్ పరస్పర చర్యలను నిర్ధారించడానికి మరియు నవల ప్రోటీన్-ప్రోటీన్ పరస్పర చర్యలను గుర్తించడానికి ప్రారంభ స్క్రీనింగ్ సాధనాలుగా కూడా పుల్-డౌన్ పరీక్షలు ఉపయోగపడతాయి. సింథటిక్ పెప్టైడ్‌లు సాధారణంగా బైండింగ్‌కు పోటీగా అంతరాయం కలిగించడం ద్వారా అనుమానిత ప్రోటీన్-ప్రోటీన్ పరస్పర చర్యలను ధృవీకరించడానికి ఉపయోగిస్తారు. బయోటైనిలేటెడ్ పెప్టైడ్‌లు, నిర్దిష్ట ఫంక్షనల్ డొమైన్‌ను కలిగి ఉంటాయి మరియు వాటి సంబంధిత నియంత్రణ స్థానిక పెప్టైడ్‌లు అవిడిన్-కంజుగేటెడ్ రెసిన్‌లకు స్థిరీకరించబడతాయి. నమూనాలు రెసిన్లతో పొదిగేవి. ఏదైనా అన్‌బౌండ్ ప్రోటీన్‌లను తొలగించడానికి రెసిన్‌లను కడగాలి. కట్టుబడి ఉన్న ప్రోటీన్లు SDS-PAGEని ఉపయోగించి తొలగించబడతాయి మరియు విశ్లేషించబడతాయి.
ప్రొటీన్ పెప్టైడ్ ఇంటరాక్షన్స్ సంబంధిత జర్నల్స్
బయో ఇంజినీరింగ్ & బయోమెడికల్ సైన్స్ జర్నల్స్, ప్రోటీమిక్స్ & బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్, సెల్ సైన్స్ & థెరపీ, సెల్యులార్ & మాలిక్యులర్ బయాలజీ, ప్రోటీన్ ఇంజనీరింగ్ డిజైన్ మరియు సెలక్షన్, ప్రొటీన్ కెమిస్ట్రీ, అమినో యాసిడ్స్, పెప్టైడ్స్ మరియు ప్రొటీన్‌లలో పురోగతి.