మెరుగైన కార్యకలాపాలు, ప్రత్యేకతలు మరియు స్థిరత్వంతో ఎంజైమ్‌లను నిర్మించే లక్ష్యంతో ప్రోటీన్ ఇంజనీరింగ్ వ్యూహాలు సిలికో పద్ధతుల నుండి చాలా ప్రయోజనం పొందుతాయి. గణన పద్ధతులను ప్రధానంగా మూడు ప్రధాన వర్గాలుగా వర్గీకరించవచ్చు. అవి బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్, మాలిక్యులర్ మోడలింగ్ మరియు డి నోవో డిజైన్. కంప్యూటేషనల్ ఎంజైమ్ డిజైన్ అనేది పరిశోధనలో చాలా ఆశాజనకమైన ప్రాంతం. ప్రస్తుత గణన రూపకల్పన సాధనాలు తీవ్రమైన పరిమితితో బాధపడుతున్నాయి.
కొత్త లేదా మెరుగైన కార్యకలాపాలు, ప్రత్యేకతలు మరియు స్థిరత్వంతో ఎంజైమ్‌లను నిర్మించే లక్ష్యంతో ప్రోటీన్ ఇంజనీరింగ్ వ్యూహాలు సిలికో పద్ధతుల నుండి చాలా ప్రయోజనం పొందుతాయి. గణన పద్ధతులను ప్రధానంగా మూడు ప్రధాన వర్గాలుగా వర్గీకరించవచ్చు: బయోఇన్ఫర్మేటిక్స్; మాలిక్యులర్ మోడలింగ్; మరియు డి నోవో డిజైన్.ముఖ్యంగా డి నోవో ప్రోటీన్ డిజైన్ వేగంగా అభివృద్ధి చెందుతోంది, ఫలితంగా మరింత పటిష్టమైన మరియు నమ్మదగిన అంచనాలు వచ్చాయి. ఈ రంగంలో ఇటీవలి ట్రెండ్ అనేక గణన విధానాలను ఇంటరాక్టివ్ పద్ధతిలో కలపడం మరియు నిర్మాణాత్మక విశ్లేషణ మరియు నిర్దేశిత పరిణామంతో వాటిని పూర్తి చేయడం. రూపొందించబడిన ఉత్ప్రేరకాల యొక్క వివరణాత్మక పరిశోధన పరమాణు గుర్తింపు, జీవరసాయన ఉత్ప్రేరకము మరియు సహజ ప్రోటీన్ పరిణామం యొక్క నిర్మాణ ప్రాతిపదికపై విలువైన సమాచారాన్ని అందిస్తుంది.
ఎంజైమ్‌ల ఇన్సిలికో డిజైన్ సంబంధిత జర్నల్‌లు
జెనోమిక్స్ & ప్రోటీమిక్స్ జర్నల్‌లో డేటా మైనింగ్, సింగిల్ సెల్ బయాలజీ జర్నల్‌లు, జెనోమిక్ మెడిసిన్ జర్నల్స్, జర్నల్ ఆఫ్ టిష్యూ సైన్స్ & ఇంజనీరింగ్, జర్నల్ ఆఫ్ కెమిన్‌ఫర్మేటిక్స్, కరెంట్ సింథటిక్ అండ్ సిస్టమ్స్ బయాలజీ, క్లినికల్ & మెడికల్ జెనోమిక్స్, కెమికల్ బయాలజీ మరియు డ్రగ్ డిజైన్, డ్రగ్ డిజైన్, డ్రగ్ డిజైన్ ఇంటర్నేషనల్ జర్నల్ ఆఫ్ కంప్యూటేషనల్ బయాలజీ అండ్ డ్రగ్ డిజైన్.