యూరోపియన్ జర్నల్ ఆఫ్ క్లినికల్ ఆంకాలజీ

???????????‌?? ???????????? ?????‌?????????‌??: LAMMPS ????????? ????????? ?????????, ????? ??????? ????? ?????????????? ???‌????‌? ???? ??????????? ????????? ???‌?????????

రెజా బోజోర్గ్‌పూర్

గణన పద్ధతుల యొక్క వేగవంతమైన పురోగతితో, పరమాణు డైనమిక్స్ (MD) అనుకరణలు బయోమెడికల్ పరిశోధనలో శక్తివంతమైన సాధనాలుగా ఉద్భవించాయి, పరమాణు స్థాయిలో జీవ వ్యవస్థల యొక్క లోతైన పరిశోధనలను ప్రారంభించాయి. అందుబాటులో ఉన్న విభిన్న శ్రేణి అనుకరణ సాఫ్ట్‌వేర్‌లలో, LAMMPS (లార్జ్-స్కేల్ అటామిక్/మాలిక్యులర్ మాసివ్లీ ప్యారలల్ సిమ్యులేటర్) దాని బహుముఖ ప్రజ్ఞ, స్కేలబిలిటీ మరియు విస్తృతమైన కార్యాచరణల కోసం గణనీయమైన గుర్తింపును పొందింది. ఈ సాహిత్య సమీక్ష బయోమెడికల్ అప్లికేషన్స్ రంగంలో LAMMPS యొక్క వినియోగం యొక్క సమగ్ర అవలోకనాన్ని అందించడం లక్ష్యంగా పెట్టుకుంది.

ఈ సమీక్ష MD అనుకరణల యొక్క ప్రాథమిక సూత్రాలను వివరించడం ద్వారా మరియు బయోమెడికల్ పరిశోధనకు అనుకూలంగా ఉండే LAMMPS యొక్క ప్రత్యేక లక్షణాలను హైలైట్ చేయడం ద్వారా ప్రారంభమవుతుంది. తదనంతరం, ప్రోటీన్ ఫోల్డింగ్, డ్రగ్ డిజైన్, బయోమెటీరియల్స్ మరియు సెల్యులార్ ప్రక్రియలు వంటి వివిధ బయోమెడికల్ సందర్భాలలో LAMMPSని ఉపయోగించిన కీలక అధ్యయనాలను గుర్తించడానికి సాహిత్యం యొక్క సర్వే నిర్వహించబడుతుంది.

సమీక్షించబడిన అధ్యయనాలు జీవ స్థూల కణాల ప్రవర్తనను అర్థం చేసుకోవడం, ఔషధ-ప్రోటీన్ పరస్పర చర్యలను పరిశోధించడం, బయోమెటీరియల్స్ యొక్క యాంత్రిక లక్షణాలను విశదీకరించడం మరియు పరమాణు స్థాయిలో సెల్యులార్ ప్రక్రియలను అధ్యయనం చేయడంలో LAMMPS యొక్క విశేషమైన సహకారాన్ని ప్రదర్శిస్తాయి. అదనంగా, ఈ సమీక్ష ఇతర గణన సాధనాలు మరియు ప్రయోగాత్మక పద్ధతులతో LAMMPS యొక్క ఏకీకరణను అన్వేషిస్తుంది, సిద్ధాంతం మరియు ప్రయోగాల మధ్య అంతరాన్ని తగ్గించే సినర్జిస్టిక్ పరిశోధనల కోసం దాని సామర్థ్యాన్ని ప్రదర్శిస్తుంది. అంతేకాకుండా, ఈ సమీక్ష బయోమెడికల్ సిమ్యులేషన్‌లలో LAMMPSని ఉపయోగించడంతో సంబంధం ఉన్న సవాళ్లు మరియు పరిమితులను చర్చిస్తుంది, ఇందులో ఫోర్స్ ఫీల్డ్‌ల పారామిటరైజేషన్, సిస్టమ్ పరిమాణ పరిమితులు మరియు గణన సామర్థ్యం ఉన్నాయి. బయోమెడికల్ రంగంలో LAMMPS సామర్థ్యాలను పెంపొందించడానికి సంభావ్య భవిష్యత్ దిశలతో పాటు, ఈ సవాళ్లను తగ్గించడానికి పరిశోధకులు ఉపయోగించే వ్యూహాలు అందించబడ్డాయి.